联合舰队在击败外星舰队后，并没有时间来庆祝这来之不易的胜利。夜影敏锐地感觉到，这次的入侵只是一个更大阴谋的前奏。

舰队在修整期间，夜影召集了核心成员进行战略商讨。“这次的外星舰队出现得太突然，而且他们的武器和战术都显示出高度的组织性和计划性。这背后肯定有更强大的势力在操纵。”夜影的目光中充满了忧虑。

艾拉点头表示同意：“我也有同感。而且从他们的通讯频道中，我们捕捉到了一些模糊的信息，似乎提到了一个名为‘暗影主宰’的存在。”

汤姆皱起眉头：“‘暗影主宰’？从未听说过。但听起来不是个好对付的角色。”

鬼医则担心地说：“不管是什么，我们都要做好充分的准备。战士们刚刚经历了一场大战，身心都需要时间恢复。”

夜影沉思片刻后说道：“加快舰队的修复和补给工作，同时加强情报收集和分析。我们必须尽快弄清楚这个‘暗影主宰’的目的和计划。”

在接下来的日子里，联合舰队的成员们都忙碌起来。科学家们对缴获的外星战舰和武器进行研究，试图获取更多的技术和情报；情报人员则在各个星系中穿梭，收集一切可能有用的信息。

终于，有一天，一名情报人员带回了一个令人震惊的消息。“我们发现了一些关于‘暗影主宰’的线索。据说他掌控着一个庞大的黑暗帝国，一直在暗中策划着征服整个宇宙。这次对我们的攻击，只是他们计划的一小部分。”

夜影听后，表情变得更加严肃：“看来我们面临的是一个极其强大的敌人。”

就在这时，舰队的警报突然响起。“报告，有大量不明物体正在接近我们的位置！”

夜影立刻下令：“全体进入战斗状态！”

当联合舰队看清来者时，发现是一群形状怪异的生物战舰。这些战舰不仅外形奇特，而且释放出一种强大的干扰波，影响了联合舰队的通讯和武器系统。

“该死，这是什么东西？”汤姆咒骂道。

夜影冷静地指挥着：“不要慌乱，按照应急预案进行操作！”

战士们努力抵抗着敌人的攻击，但由于干扰波的影响，联合舰队逐渐陷入了被动。

艾拉焦急地说：“这样下去不是办法，我们必须找到干扰波的源头并摧毁它！”

经过一番艰难的搜索，终于发现了干扰波的发射源——一艘巨大的生物母舰。

夜影果断下令：“集中火力，攻击那艘母舰！”

联合舰队的战舰纷纷向生物母舰发起了攻击。在强大的火力下，生物母舰的护盾逐渐削弱。

就在即将摧毁母舰的时候，母舰突然释放出一股强大的能量脉冲，将联合舰队的部分战舰瞬间摧毁。